Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIN3BO75182 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIN3BO75182 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIN3BO75182 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SIN3BO75182 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIN3BO75182 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIN3BO75182 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIN3BO75182 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIN3BO75182 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIN3BO75182 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIN3BO75182 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIN3BO75182 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIN3BO75182 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIN3BO75182 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIN3BO75182 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIN3BO75182 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIN3BO75182 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIN3BO75182 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIN3BO75182 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SIN3BO75182 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIN3BO75182 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SIN3BO75182 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIN3BO75182 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIN3BO75182 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIN3BO75182 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIN3BO75182 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIN3BO75182 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIN3BO75182 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIN3BO75182 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIN3BO75182 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIN3BO75182 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SIN3BO75182 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIN3BO75182 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIN3BO75182 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIN3BO75182 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIN3BO75182 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIN3BO75182 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIN3BO75182 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIN3BO75182 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIN3BO75182 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIN3BO75182 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIN3BO75182 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIN3BO75182 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIN3BO75182 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SIN3BO75182 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIN3BO75182 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIN3BO75182 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIN3BO75182 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIN3BO75182 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIN3BO75182 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIN3BO75182 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIN3BO75182 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIN3BO75182 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIN3BO75182 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIN3BO75182 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIN3BO75182 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIN3BO75182 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SIN3BO75182 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIN3BO75182 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIN3BO75182 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIN3BO75182 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIN3BO75182 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SIN3BO75182 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIN3BO75182 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIN3BO75182 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIN3BO75182 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIN3BO75182 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIN3BO75182 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SIN3BO75182 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIN3BO75182 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIN3BO75182 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIN3BO75182 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIN3BO75182 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIN3BO75182 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIN3BO75182 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIN3BO75182 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SIN3BO75182 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SIN3BO75182 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SIN3BO75182 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SIN3BO75182 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SIN3BO75182 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SIN3BO75182 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SIN3BO75182 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SIN3BO75182 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SIN3BO75182 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms