Protein–RNA interactions for Protein: O60575

SPINK4, Serine protease inhibitor Kazal-type 4, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINK4O60575 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPINK4O60575 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms