Protein–RNA interactions for Protein: O60548

FOXD2, Forkhead box protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 495 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD2O60548 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXD2O60548 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXD2O60548 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FOXD2O60548 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FOXD2O60548 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FOXD2O60548 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FOXD2O60548 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
FOXD2O60548 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FOXD2O60548 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FOXD2O60548 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FOXD2O60548 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FOXD2O60548 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FOXD2O60548 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FOXD2O60548 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FOXD2O60548 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FOXD2O60548 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FOXD2O60548 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FOXD2O60548 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FOXD2O60548 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FOXD2O60548 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
FOXD2O60548 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FOXD2O60548 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FOXD2O60548 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FOXD2O60548 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FOXD2O60548 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FOXD2O60548 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXD2O60548 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXD2O60548 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXD2O60548 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXD2O60548 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXD2O60548 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXD2O60548 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXD2O60548 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXD2O60548 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXD2O60548 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXD2O60548 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXD2O60548 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXD2O60548 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXD2O60548 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXD2O60548 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXD2O60548 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXD2O60548 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXD2O60548 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXD2O60548 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXD2O60548 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXD2O60548 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXD2O60548 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXD2O60548 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXD2O60548 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXD2O60548 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXD2O60548 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXD2O60548 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXD2O60548 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXD2O60548 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXD2O60548 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXD2O60548 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXD2O60548 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
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FOXD2O60548 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXD2O60548 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXD2O60548 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXD2O60548 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXD2O60548 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXD2O60548 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXD2O60548 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXD2O60548 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
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FOXD2O60548 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXD2O60548 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FOXD2O60548 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FOXD2O60548 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FOXD2O60548 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FOXD2O60548 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FOXD2O60548 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FOXD2O60548 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FOXD2O60548 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FOXD2O60548 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FOXD2O60548 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FOXD2O60548 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FOXD2O60548 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FOXD2O60548 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
FOXD2O60548 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FOXD2O60548 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FOXD2O60548 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXD2O60548 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXD2O60548 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXD2O60548 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXD2O60548 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXD2O60548 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXD2O60548 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXD2O60548 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXD2O60548 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXD2O60548 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXD2O60548 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXD2O60548 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXD2O60548 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXD2O60548 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXD2O60548 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXD2O60548 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXD2O60548 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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