Protein–RNA interactions for Protein: O60308

CEP104, Centrosomal protein of 104 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP104O60308 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CEP104O60308 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CEP104O60308 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CEP104O60308 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CEP104O60308 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CEP104O60308 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CEP104O60308 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CEP104O60308 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CEP104O60308 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CEP104O60308 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CEP104O60308 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEP104O60308 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CEP104O60308 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEP104O60308 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEP104O60308 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEP104O60308 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEP104O60308 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEP104O60308 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEP104O60308 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CEP104O60308 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEP104O60308 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEP104O60308 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEP104O60308 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEP104O60308 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEP104O60308 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEP104O60308 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEP104O60308 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEP104O60308 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEP104O60308 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEP104O60308 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEP104O60308 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEP104O60308 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEP104O60308 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEP104O60308 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEP104O60308 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEP104O60308 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEP104O60308 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEP104O60308 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEP104O60308 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEP104O60308 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEP104O60308 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEP104O60308 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEP104O60308 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEP104O60308 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEP104O60308 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEP104O60308 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEP104O60308 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEP104O60308 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEP104O60308 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEP104O60308 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEP104O60308 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEP104O60308 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEP104O60308 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CEP104O60308 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CEP104O60308 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEP104O60308 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEP104O60308 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEP104O60308 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEP104O60308 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEP104O60308 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEP104O60308 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEP104O60308 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEP104O60308 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEP104O60308 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEP104O60308 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEP104O60308 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEP104O60308 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEP104O60308 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEP104O60308 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CEP104O60308 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEP104O60308 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEP104O60308 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEP104O60308 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEP104O60308 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEP104O60308 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEP104O60308 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEP104O60308 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEP104O60308 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEP104O60308 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEP104O60308 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEP104O60308 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEP104O60308 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEP104O60308 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEP104O60308 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEP104O60308 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEP104O60308 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEP104O60308 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEP104O60308 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEP104O60308 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEP104O60308 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEP104O60308 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CEP104O60308 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEP104O60308 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEP104O60308 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEP104O60308 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEP104O60308 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEP104O60308 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEP104O60308 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEP104O60308 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEP104O60308 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms