Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAK2O60296 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAK2O60296 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAK2O60296 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAK2O60296 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAK2O60296 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAK2O60296 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAK2O60296 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAK2O60296 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAK2O60296 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAK2O60296 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAK2O60296 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAK2O60296 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAK2O60296 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAK2O60296 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAK2O60296 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAK2O60296 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAK2O60296 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAK2O60296 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAK2O60296 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAK2O60296 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAK2O60296 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAK2O60296 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAK2O60296 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAK2O60296 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAK2O60296 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAK2O60296 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAK2O60296 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms