Protein–RNA interactions for Protein: O43752

STX6, Syntaxin-6, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX6O43752 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
STX6O43752 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
STX6O43752 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
STX6O43752 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
STX6O43752 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
STX6O43752 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
STX6O43752 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
STX6O43752 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STX6O43752 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STX6O43752 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STX6O43752 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STX6O43752 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STX6O43752 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
STX6O43752 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STX6O43752 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STX6O43752 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STX6O43752 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STX6O43752 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STX6O43752 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STX6O43752 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STX6O43752 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STX6O43752 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STX6O43752 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STX6O43752 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STX6O43752 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STX6O43752 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
STX6O43752 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
STX6O43752 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
STX6O43752 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
STX6O43752 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
STX6O43752 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
STX6O43752 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
STX6O43752 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
STX6O43752 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
STX6O43752 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
STX6O43752 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
STX6O43752 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
STX6O43752 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
STX6O43752 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
STX6O43752 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
STX6O43752 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STX6O43752 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STX6O43752 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
STX6O43752 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
STX6O43752 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STX6O43752 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
STX6O43752 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
STX6O43752 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STX6O43752 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
STX6O43752 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STX6O43752 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
STX6O43752 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
STX6O43752 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
STX6O43752 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STX6O43752 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
STX6O43752 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STX6O43752 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STX6O43752 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
STX6O43752 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STX6O43752 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
STX6O43752 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
STX6O43752 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
STX6O43752 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
STX6O43752 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STX6O43752 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
STX6O43752 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STX6O43752 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STX6O43752 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STX6O43752 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
STX6O43752 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
STX6O43752 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
STX6O43752 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
STX6O43752 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
STX6O43752 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
STX6O43752 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
STX6O43752 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
STX6O43752 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
STX6O43752 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
STX6O43752 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
STX6O43752 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
STX6O43752 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
STX6O43752 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
STX6O43752 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STX6O43752 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STX6O43752 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STX6O43752 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
STX6O43752 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STX6O43752 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STX6O43752 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STX6O43752 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STX6O43752 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STX6O43752 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STX6O43752 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STX6O43752 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
STX6O43752 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STX6O43752 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STX6O43752 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STX6O43752 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
STX6O43752 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
STX6O43752 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms