Protein–RNA interactions for Protein: O43524

FOXO3, Forkhead box protein O3, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO3O43524 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FOXO3O43524 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
FOXO3O43524 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
FOXO3O43524 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
FOXO3O43524 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
FOXO3O43524 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
FOXO3O43524 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
FOXO3O43524 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
FOXO3O43524 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
FOXO3O43524 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
FOXO3O43524 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
FOXO3O43524 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
FOXO3O43524 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
FOXO3O43524 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
FOXO3O43524 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
FOXO3O43524 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
FOXO3O43524 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
FOXO3O43524 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
FOXO3O43524 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
FOXO3O43524 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
FOXO3O43524 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
FOXO3O43524 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
FOXO3O43524 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
FOXO3O43524 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
FOXO3O43524 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
FOXO3O43524 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
FOXO3O43524 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
FOXO3O43524 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
FOXO3O43524 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
FOXO3O43524 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
FOXO3O43524 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
FOXO3O43524 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
FOXO3O43524 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
FOXO3O43524 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
FOXO3O43524 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
FOXO3O43524 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
FOXO3O43524 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
FOXO3O43524 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
FOXO3O43524 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC29■■■□□ 2.23
FOXO3O43524 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
FOXO3O43524 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
FOXO3O43524 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC29■■■□□ 2.23
FOXO3O43524 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
FOXO3O43524 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
FOXO3O43524 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
FOXO3O43524 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
FOXO3O43524 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
FOXO3O43524 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
FOXO3O43524 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
FOXO3O43524 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
FOXO3O43524 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
FOXO3O43524 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
FOXO3O43524 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
FOXO3O43524 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
FOXO3O43524 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
FOXO3O43524 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
FOXO3O43524 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
FOXO3O43524 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
FOXO3O43524 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
FOXO3O43524 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
FOXO3O43524 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
FOXO3O43524 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
FOXO3O43524 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
FOXO3O43524 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
FOXO3O43524 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
FOXO3O43524 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
FOXO3O43524 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
FOXO3O43524 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
FOXO3O43524 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
FOXO3O43524 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
FOXO3O43524 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
FOXO3O43524 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
FOXO3O43524 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
FOXO3O43524 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FOXO3O43524 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FOXO3O43524 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
FOXO3O43524 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FOXO3O43524 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FOXO3O43524 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
FOXO3O43524 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
FOXO3O43524 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FOXO3O43524 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
FOXO3O43524 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
FOXO3O43524 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FOXO3O43524 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FOXO3O43524 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
FOXO3O43524 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FOXO3O43524 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
FOXO3O43524 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
FOXO3O43524 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
FOXO3O43524 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
FOXO3O43524 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
FOXO3O43524 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
FOXO3O43524 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
FOXO3O43524 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
FOXO3O43524 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
FOXO3O43524 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
FOXO3O43524 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
FOXO3O43524 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
FOXO3O43524 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms