Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTIFO43310 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTIFO43310 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CTIFO43310 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTIFO43310 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTIFO43310 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTIFO43310 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTIFO43310 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTIFO43310 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTIFO43310 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTIFO43310 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTIFO43310 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTIFO43310 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTIFO43310 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTIFO43310 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTIFO43310 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTIFO43310 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTIFO43310 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTIFO43310 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTIFO43310 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTIFO43310 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTIFO43310 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTIFO43310 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTIFO43310 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTIFO43310 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTIFO43310 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTIFO43310 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTIFO43310 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTIFO43310 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTIFO43310 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTIFO43310 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTIFO43310 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTIFO43310 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTIFO43310 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTIFO43310 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTIFO43310 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTIFO43310 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTIFO43310 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTIFO43310 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTIFO43310 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTIFO43310 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTIFO43310 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTIFO43310 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTIFO43310 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTIFO43310 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTIFO43310 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTIFO43310 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTIFO43310 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTIFO43310 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTIFO43310 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTIFO43310 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTIFO43310 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTIFO43310 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTIFO43310 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTIFO43310 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTIFO43310 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTIFO43310 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTIFO43310 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTIFO43310 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTIFO43310 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTIFO43310 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTIFO43310 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTIFO43310 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTIFO43310 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTIFO43310 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTIFO43310 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CTIFO43310 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTIFO43310 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTIFO43310 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTIFO43310 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTIFO43310 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTIFO43310 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTIFO43310 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTIFO43310 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTIFO43310 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTIFO43310 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CTIFO43310 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTIFO43310 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTIFO43310 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTIFO43310 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTIFO43310 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTIFO43310 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTIFO43310 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTIFO43310 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTIFO43310 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTIFO43310 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTIFO43310 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTIFO43310 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTIFO43310 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CTIFO43310 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTIFO43310 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTIFO43310 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTIFO43310 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTIFO43310 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTIFO43310 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTIFO43310 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTIFO43310 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTIFO43310 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTIFO43310 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTIFO43310 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
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