Protein–RNA interactions for Protein: O43248

HOXC11, Homeobox protein Hox-C11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11O43248 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXC11O43248 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXC11O43248 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXC11O43248 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXC11O43248 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXC11O43248 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXC11O43248 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXC11O43248 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXC11O43248 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXC11O43248 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXC11O43248 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXC11O43248 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXC11O43248 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXC11O43248 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXC11O43248 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXC11O43248 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXC11O43248 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXC11O43248 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXC11O43248 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXC11O43248 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXC11O43248 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXC11O43248 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXC11O43248 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXC11O43248 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXC11O43248 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXC11O43248 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXC11O43248 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXC11O43248 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXC11O43248 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXC11O43248 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXC11O43248 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXC11O43248 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXC11O43248 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXC11O43248 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXC11O43248 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXC11O43248 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXC11O43248 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXC11O43248 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXC11O43248 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXC11O43248 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXC11O43248 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXC11O43248 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXC11O43248 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXC11O43248 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXC11O43248 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXC11O43248 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXC11O43248 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXC11O43248 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXC11O43248 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXC11O43248 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXC11O43248 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXC11O43248 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXC11O43248 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXC11O43248 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXC11O43248 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXC11O43248 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXC11O43248 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXC11O43248 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXC11O43248 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXC11O43248 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXC11O43248 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXC11O43248 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXC11O43248 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXC11O43248 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXC11O43248 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC11O43248 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC11O43248 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC11O43248 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC11O43248 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC11O43248 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC11O43248 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC11O43248 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC11O43248 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC11O43248 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC11O43248 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC11O43248 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC11O43248 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXC11O43248 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXC11O43248 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXC11O43248 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXC11O43248 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXC11O43248 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXC11O43248 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXC11O43248 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXC11O43248 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
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