Protein–RNA interactions for Protein: O15541

RNF113A, RING finger protein 113A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF113AO15541 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF113AO15541 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF113AO15541 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF113AO15541 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF113AO15541 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF113AO15541 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF113AO15541 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF113AO15541 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF113AO15541 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF113AO15541 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF113AO15541 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF113AO15541 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF113AO15541 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF113AO15541 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF113AO15541 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF113AO15541 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF113AO15541 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF113AO15541 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF113AO15541 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF113AO15541 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF113AO15541 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF113AO15541 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF113AO15541 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF113AO15541 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF113AO15541 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF113AO15541 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF113AO15541 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF113AO15541 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF113AO15541 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF113AO15541 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF113AO15541 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RNF113AO15541 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RNF113AO15541 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RNF113AO15541 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RNF113AO15541 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RNF113AO15541 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RNF113AO15541 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RNF113AO15541 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RNF113AO15541 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RNF113AO15541 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RNF113AO15541 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF113AO15541 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF113AO15541 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF113AO15541 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF113AO15541 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF113AO15541 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF113AO15541 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF113AO15541 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF113AO15541 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF113AO15541 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF113AO15541 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF113AO15541 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF113AO15541 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF113AO15541 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF113AO15541 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF113AO15541 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF113AO15541 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF113AO15541 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF113AO15541 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF113AO15541 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF113AO15541 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF113AO15541 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF113AO15541 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF113AO15541 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF113AO15541 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF113AO15541 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF113AO15541 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF113AO15541 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF113AO15541 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF113AO15541 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF113AO15541 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF113AO15541 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF113AO15541 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF113AO15541 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF113AO15541 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF113AO15541 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF113AO15541 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF113AO15541 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF113AO15541 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF113AO15541 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF113AO15541 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF113AO15541 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF113AO15541 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF113AO15541 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF113AO15541 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF113AO15541 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF113AO15541 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF113AO15541 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF113AO15541 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF113AO15541 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF113AO15541 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF113AO15541 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF113AO15541 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF113AO15541 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF113AO15541 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF113AO15541 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF113AO15541 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF113AO15541 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF113AO15541 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF113AO15541 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
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