Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CLOCKO15516 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLOCKO15516 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLOCKO15516 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLOCKO15516 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLOCKO15516 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLOCKO15516 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLOCKO15516 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLOCKO15516 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLOCKO15516 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLOCKO15516 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLOCKO15516 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLOCKO15516 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLOCKO15516 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLOCKO15516 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLOCKO15516 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLOCKO15516 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLOCKO15516 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLOCKO15516 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLOCKO15516 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CLOCKO15516 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLOCKO15516 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLOCKO15516 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLOCKO15516 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLOCKO15516 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLOCKO15516 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLOCKO15516 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLOCKO15516 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLOCKO15516 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLOCKO15516 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLOCKO15516 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CLOCKO15516 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLOCKO15516 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLOCKO15516 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLOCKO15516 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLOCKO15516 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLOCKO15516 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLOCKO15516 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLOCKO15516 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLOCKO15516 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLOCKO15516 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLOCKO15516 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLOCKO15516 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLOCKO15516 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLOCKO15516 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLOCKO15516 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLOCKO15516 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLOCKO15516 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLOCKO15516 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLOCKO15516 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLOCKO15516 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLOCKO15516 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLOCKO15516 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLOCKO15516 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLOCKO15516 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLOCKO15516 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLOCKO15516 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLOCKO15516 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLOCKO15516 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLOCKO15516 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLOCKO15516 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLOCKO15516 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLOCKO15516 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLOCKO15516 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CLOCKO15516 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLOCKO15516 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLOCKO15516 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLOCKO15516 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLOCKO15516 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLOCKO15516 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLOCKO15516 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLOCKO15516 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.89■□□□□ 0.78
CLOCKO15516 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLOCKO15516 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLOCKO15516 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLOCKO15516 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLOCKO15516 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLOCKO15516 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLOCKO15516 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLOCKO15516 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLOCKO15516 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLOCKO15516 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLOCKO15516 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLOCKO15516 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLOCKO15516 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLOCKO15516 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLOCKO15516 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLOCKO15516 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLOCKO15516 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLOCKO15516 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLOCKO15516 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CLOCKO15516 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CLOCKO15516 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLOCKO15516 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLOCKO15516 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLOCKO15516 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLOCKO15516 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLOCKO15516 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLOCKO15516 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLOCKO15516 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms