Protein–RNA interactions for Protein: O15511

ARPC5, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC5O15511 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms