Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARPC1BO15143 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARPC1BO15143 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms