Protein–RNA interactions for Protein: O15041

SEMA3E, Semaphorin-3E, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3EO15041 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEMA3EO15041 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEMA3EO15041 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEMA3EO15041 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEMA3EO15041 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEMA3EO15041 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEMA3EO15041 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEMA3EO15041 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEMA3EO15041 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEMA3EO15041 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEMA3EO15041 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEMA3EO15041 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEMA3EO15041 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEMA3EO15041 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEMA3EO15041 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEMA3EO15041 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEMA3EO15041 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEMA3EO15041 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEMA3EO15041 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEMA3EO15041 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEMA3EO15041 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEMA3EO15041 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEMA3EO15041 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEMA3EO15041 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEMA3EO15041 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEMA3EO15041 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEMA3EO15041 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEMA3EO15041 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEMA3EO15041 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEMA3EO15041 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEMA3EO15041 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEMA3EO15041 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEMA3EO15041 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEMA3EO15041 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SEMA3EO15041 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEMA3EO15041 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEMA3EO15041 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEMA3EO15041 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SEMA3EO15041 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEMA3EO15041 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEMA3EO15041 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEMA3EO15041 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEMA3EO15041 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEMA3EO15041 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEMA3EO15041 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SEMA3EO15041 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEMA3EO15041 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEMA3EO15041 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEMA3EO15041 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEMA3EO15041 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SEMA3EO15041 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEMA3EO15041 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEMA3EO15041 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEMA3EO15041 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEMA3EO15041 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEMA3EO15041 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEMA3EO15041 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEMA3EO15041 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SEMA3EO15041 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SEMA3EO15041 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SEMA3EO15041 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SEMA3EO15041 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SEMA3EO15041 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SEMA3EO15041 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SEMA3EO15041 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SEMA3EO15041 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SEMA3EO15041 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SEMA3EO15041 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SEMA3EO15041 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SEMA3EO15041 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SEMA3EO15041 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SEMA3EO15041 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SEMA3EO15041 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SEMA3EO15041 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEMA3EO15041 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEMA3EO15041 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEMA3EO15041 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEMA3EO15041 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEMA3EO15041 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEMA3EO15041 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SEMA3EO15041 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEMA3EO15041 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEMA3EO15041 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEMA3EO15041 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEMA3EO15041 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEMA3EO15041 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEMA3EO15041 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEMA3EO15041 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEMA3EO15041 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEMA3EO15041 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEMA3EO15041 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEMA3EO15041 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEMA3EO15041 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEMA3EO15041 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEMA3EO15041 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEMA3EO15041 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEMA3EO15041 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEMA3EO15041 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEMA3EO15041 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEMA3EO15041 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms