Protein–RNA interactions for Protein: O14578

CIT, Citron Rho-interacting kinase, humanhuman

Predictions only

Length 2,027 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITO14578 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CITO14578 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CITO14578 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CITO14578 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CITO14578 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CITO14578 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CITO14578 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CITO14578 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CITO14578 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CITO14578 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CITO14578 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CITO14578 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CITO14578 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CITO14578 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CITO14578 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CITO14578 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CITO14578 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CITO14578 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CITO14578 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CITO14578 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CITO14578 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CITO14578 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CITO14578 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CITO14578 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CITO14578 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CITO14578 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CITO14578 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CITO14578 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CITO14578 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CITO14578 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CITO14578 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CITO14578 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CITO14578 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CITO14578 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CITO14578 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CITO14578 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CITO14578 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CITO14578 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CITO14578 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CITO14578 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CITO14578 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CITO14578 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CITO14578 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CITO14578 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CITO14578 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CITO14578 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CITO14578 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CITO14578 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CITO14578 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CITO14578 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CITO14578 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CITO14578 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CITO14578 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CITO14578 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CITO14578 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CITO14578 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CITO14578 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CITO14578 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CITO14578 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CITO14578 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CITO14578 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CITO14578 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CITO14578 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CITO14578 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CITO14578 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CITO14578 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CITO14578 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CITO14578 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CITO14578 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CITO14578 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CITO14578 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CITO14578 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CITO14578 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CITO14578 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CITO14578 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CITO14578 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CITO14578 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CITO14578 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CITO14578 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CITO14578 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CITO14578 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CITO14578 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CITO14578 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CITO14578 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CITO14578 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CITO14578 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CITO14578 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CITO14578 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CITO14578 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CITO14578 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CITO14578 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CITO14578 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CITO14578 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CITO14578 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CITO14578 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CITO14578 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CITO14578 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CITO14578 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CITO14578 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CITO14578 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms