Protein–RNA interactions for Protein: O00628

PEX7, Peroxisomal targeting signal 2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX7O00628 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PEX7O00628 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PEX7O00628 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PEX7O00628 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PEX7O00628 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PEX7O00628 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PEX7O00628 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PEX7O00628 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX7O00628 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX7O00628 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX7O00628 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX7O00628 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX7O00628 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX7O00628 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX7O00628 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX7O00628 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX7O00628 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX7O00628 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX7O00628 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX7O00628 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX7O00628 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX7O00628 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX7O00628 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX7O00628 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX7O00628 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX7O00628 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX7O00628 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX7O00628 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX7O00628 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX7O00628 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX7O00628 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX7O00628 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX7O00628 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX7O00628 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX7O00628 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX7O00628 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX7O00628 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX7O00628 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX7O00628 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX7O00628 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX7O00628 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX7O00628 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX7O00628 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX7O00628 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX7O00628 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX7O00628 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX7O00628 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX7O00628 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX7O00628 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX7O00628 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX7O00628 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX7O00628 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX7O00628 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PEX7O00628 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PEX7O00628 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PEX7O00628 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PEX7O00628 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PEX7O00628 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PEX7O00628 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PEX7O00628 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PEX7O00628 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PEX7O00628 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PEX7O00628 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PEX7O00628 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PEX7O00628 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PEX7O00628 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PEX7O00628 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PEX7O00628 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PEX7O00628 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PEX7O00628 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PEX7O00628 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PEX7O00628 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PEX7O00628 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PEX7O00628 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PEX7O00628 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PEX7O00628 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PEX7O00628 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PEX7O00628 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PEX7O00628 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PEX7O00628 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PEX7O00628 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PEX7O00628 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PEX7O00628 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PEX7O00628 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PEX7O00628 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PEX7O00628 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PEX7O00628 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PEX7O00628 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PEX7O00628 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PEX7O00628 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PEX7O00628 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PEX7O00628 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PEX7O00628 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PEX7O00628 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PEX7O00628 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PEX7O00628 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PEX7O00628 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PEX7O00628 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PEX7O00628 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PEX7O00628 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms