Protein–RNA interactions for Protein: O00370

LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
O00370 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
O00370 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
O00370 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
O00370 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
O00370 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
O00370 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
O00370 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
O00370 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
O00370 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
O00370 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
O00370 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
O00370 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
O00370 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
O00370 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
O00370 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
O00370 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
O00370 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
O00370 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
O00370 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
O00370 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
O00370 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
O00370 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
O00370 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
O00370 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
O00370 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
O00370 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
O00370 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
O00370 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
O00370 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
O00370 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
O00370 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
O00370 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
O00370 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
O00370 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
O00370 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
O00370 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
O00370 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
O00370 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
O00370 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
O00370 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
O00370 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
O00370 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
O00370 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
O00370 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
O00370 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
O00370 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
O00370 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
O00370 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
O00370 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
O00370 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
O00370 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
O00370 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
O00370 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
O00370 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
O00370 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
O00370 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
O00370 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
O00370 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
O00370 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
O00370 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
O00370 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
O00370 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
O00370 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
O00370 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
O00370 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
O00370 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
O00370 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
O00370 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
O00370 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
O00370 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
O00370 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
O00370 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
O00370 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
O00370 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
O00370 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
O00370 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
O00370 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
O00370 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
O00370 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
O00370 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
O00370 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
O00370 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
O00370 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
O00370 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
O00370 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
O00370 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
O00370 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
O00370 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
O00370 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
O00370 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
O00370 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
O00370 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
O00370 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
O00370 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
O00370 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
O00370 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
O00370 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
O00370 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
O00370 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
O00370 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms