Protein–RNA interactions for Protein: I3L4J1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
I3L4J1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
I3L4J1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
I3L4J1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
I3L4J1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
I3L4J1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
I3L4J1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
I3L4J1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
I3L4J1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
I3L4J1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
I3L4J1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
I3L4J1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
I3L4J1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
I3L4J1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
I3L4J1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
I3L4J1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
I3L4J1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
I3L4J1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
I3L4J1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
I3L4J1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
I3L4J1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
I3L4J1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
I3L4J1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
I3L4J1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
I3L4J1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
I3L4J1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
I3L4J1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
I3L4J1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
I3L4J1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
I3L4J1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
I3L4J1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
I3L4J1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
I3L4J1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
I3L4J1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
I3L4J1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
I3L4J1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
I3L4J1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
I3L4J1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
I3L4J1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
I3L4J1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
I3L4J1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
I3L4J1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
I3L4J1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
I3L4J1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
I3L4J1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
I3L4J1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
I3L4J1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
I3L4J1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
I3L4J1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
I3L4J1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
I3L4J1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
I3L4J1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
I3L4J1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
I3L4J1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
I3L4J1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
I3L4J1 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
I3L4J1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
I3L4J1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
I3L4J1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
I3L4J1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
I3L4J1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
I3L4J1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
I3L4J1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
I3L4J1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
I3L4J1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
I3L4J1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
I3L4J1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
I3L4J1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
I3L4J1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
I3L4J1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
I3L4J1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
I3L4J1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
I3L4J1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
I3L4J1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
I3L4J1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
I3L4J1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
I3L4J1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
I3L4J1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
I3L4J1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
I3L4J1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
I3L4J1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
I3L4J1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
I3L4J1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
I3L4J1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
I3L4J1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
I3L4J1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
I3L4J1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
I3L4J1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
I3L4J1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
I3L4J1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
I3L4J1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
I3L4J1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
I3L4J1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
I3L4J1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
I3L4J1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
I3L4J1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
I3L4J1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
I3L4J1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
I3L4J1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
I3L4J1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
I3L4J1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms