Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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