Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1E9PL57 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1E9PL57 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1E9PL57 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1E9PL57 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1E9PL57 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1E9PL57 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1E9PL57 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1E9PL57 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1E9PL57 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1E9PL57 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1E9PL57 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1E9PL57 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1E9PL57 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1E9PL57 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1E9PL57 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1E9PL57 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms