Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
E9PBE3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
E9PBE3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E9PBE3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
E9PBE3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E9PBE3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
E9PBE3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
E9PBE3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E9PBE3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
E9PBE3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E9PBE3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
E9PBE3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E9PBE3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
E9PBE3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
E9PBE3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E9PBE3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
E9PBE3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E9PBE3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
E9PBE3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
E9PBE3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
E9PBE3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
E9PBE3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E9PBE3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E9PBE3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
E9PBE3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E9PBE3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E9PBE3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
E9PBE3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E9PBE3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
E9PBE3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E9PBE3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
E9PBE3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
E9PBE3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E9PBE3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
E9PBE3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E9PBE3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E9PBE3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
E9PBE3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E9PBE3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E9PBE3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E9PBE3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
E9PBE3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
E9PBE3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
E9PBE3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
E9PBE3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
E9PBE3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
E9PBE3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
E9PBE3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
E9PBE3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
E9PBE3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
E9PBE3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
E9PBE3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
E9PBE3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
E9PBE3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
E9PBE3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
E9PBE3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
E9PBE3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
E9PBE3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
E9PBE3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
E9PBE3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
E9PBE3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
E9PBE3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
E9PBE3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
E9PBE3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
E9PBE3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
E9PBE3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
E9PBE3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
E9PBE3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
E9PBE3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
E9PBE3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
E9PBE3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
E9PBE3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
E9PBE3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
E9PBE3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
E9PBE3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
E9PBE3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
E9PBE3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
E9PBE3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
E9PBE3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
E9PBE3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E9PBE3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
E9PBE3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E9PBE3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E9PBE3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E9PBE3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
E9PBE3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
E9PBE3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
E9PBE3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
E9PBE3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E9PBE3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
E9PBE3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E9PBE3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E9PBE3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E9PBE3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
E9PBE3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E9PBE3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
E9PBE3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E9PBE3 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
E9PBE3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
E9PBE3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.8 ms