Protein–RNA interactions for Protein: A8MV81

HIGD1C, HIG1 domain family member 1C, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1CA8MV81 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIGD1CA8MV81 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIGD1CA8MV81 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIGD1CA8MV81 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIGD1CA8MV81 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIGD1CA8MV81 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIGD1CA8MV81 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIGD1CA8MV81 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIGD1CA8MV81 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIGD1CA8MV81 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIGD1CA8MV81 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIGD1CA8MV81 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIGD1CA8MV81 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIGD1CA8MV81 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIGD1CA8MV81 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIGD1CA8MV81 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIGD1CA8MV81 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIGD1CA8MV81 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIGD1CA8MV81 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIGD1CA8MV81 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIGD1CA8MV81 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIGD1CA8MV81 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIGD1CA8MV81 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIGD1CA8MV81 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIGD1CA8MV81 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIGD1CA8MV81 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIGD1CA8MV81 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIGD1CA8MV81 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIGD1CA8MV81 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HIGD1CA8MV81 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIGD1CA8MV81 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIGD1CA8MV81 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIGD1CA8MV81 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIGD1CA8MV81 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIGD1CA8MV81 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HIGD1CA8MV81 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIGD1CA8MV81 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HIGD1CA8MV81 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HIGD1CA8MV81 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIGD1CA8MV81 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIGD1CA8MV81 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIGD1CA8MV81 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIGD1CA8MV81 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIGD1CA8MV81 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIGD1CA8MV81 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIGD1CA8MV81 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIGD1CA8MV81 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HIGD1CA8MV81 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIGD1CA8MV81 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIGD1CA8MV81 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIGD1CA8MV81 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIGD1CA8MV81 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIGD1CA8MV81 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIGD1CA8MV81 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HIGD1CA8MV81 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HIGD1CA8MV81 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HIGD1CA8MV81 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HIGD1CA8MV81 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HIGD1CA8MV81 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HIGD1CA8MV81 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HIGD1CA8MV81 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HIGD1CA8MV81 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HIGD1CA8MV81 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HIGD1CA8MV81 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HIGD1CA8MV81 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIGD1CA8MV81 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms