Protein–RNA interactions for Protein: A8K0S8

MEIS3P2, Putative homeobox protein Meis3-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3P2A8K0S8 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MEIS3P2A8K0S8 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MEIS3P2A8K0S8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MEIS3P2A8K0S8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MEIS3P2A8K0S8 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MEIS3P2A8K0S8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MEIS3P2A8K0S8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MEIS3P2A8K0S8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MEIS3P2A8K0S8 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MEIS3P2A8K0S8 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MEIS3P2A8K0S8 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MEIS3P2A8K0S8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MEIS3P2A8K0S8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MEIS3P2A8K0S8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MEIS3P2A8K0S8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MEIS3P2A8K0S8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MEIS3P2A8K0S8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MEIS3P2A8K0S8 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MEIS3P2A8K0S8 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MEIS3P2A8K0S8 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MEIS3P2A8K0S8 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MEIS3P2A8K0S8 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MEIS3P2A8K0S8 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MEIS3P2A8K0S8 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MEIS3P2A8K0S8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MEIS3P2A8K0S8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MEIS3P2A8K0S8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MEIS3P2A8K0S8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MEIS3P2A8K0S8 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MEIS3P2A8K0S8 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MEIS3P2A8K0S8 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MEIS3P2A8K0S8 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MEIS3P2A8K0S8 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MEIS3P2A8K0S8 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MEIS3P2A8K0S8 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MEIS3P2A8K0S8 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MEIS3P2A8K0S8 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MEIS3P2A8K0S8 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MEIS3P2A8K0S8 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MEIS3P2A8K0S8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MEIS3P2A8K0S8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MEIS3P2A8K0S8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MEIS3P2A8K0S8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MEIS3P2A8K0S8 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MEIS3P2A8K0S8 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MEIS3P2A8K0S8 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MEIS3P2A8K0S8 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MEIS3P2A8K0S8 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MEIS3P2A8K0S8 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MEIS3P2A8K0S8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MEIS3P2A8K0S8 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MEIS3P2A8K0S8 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MEIS3P2A8K0S8 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MEIS3P2A8K0S8 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MEIS3P2A8K0S8 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MEIS3P2A8K0S8 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MEIS3P2A8K0S8 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MEIS3P2A8K0S8 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MEIS3P2A8K0S8 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MEIS3P2A8K0S8 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MEIS3P2A8K0S8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MEIS3P2A8K0S8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MEIS3P2A8K0S8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MEIS3P2A8K0S8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MEIS3P2A8K0S8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MEIS3P2A8K0S8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MEIS3P2A8K0S8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MEIS3P2A8K0S8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MEIS3P2A8K0S8 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MEIS3P2A8K0S8 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MEIS3P2A8K0S8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MEIS3P2A8K0S8 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MEIS3P2A8K0S8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MEIS3P2A8K0S8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MEIS3P2A8K0S8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MEIS3P2A8K0S8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MEIS3P2A8K0S8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MEIS3P2A8K0S8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MEIS3P2A8K0S8 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MEIS3P2A8K0S8 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MEIS3P2A8K0S8 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MEIS3P2A8K0S8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MEIS3P2A8K0S8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MEIS3P2A8K0S8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MEIS3P2A8K0S8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MEIS3P2A8K0S8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MEIS3P2A8K0S8 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MEIS3P2A8K0S8 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MEIS3P2A8K0S8 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MEIS3P2A8K0S8 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MEIS3P2A8K0S8 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MEIS3P2A8K0S8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MEIS3P2A8K0S8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MEIS3P2A8K0S8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MEIS3P2A8K0S8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MEIS3P2A8K0S8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MEIS3P2A8K0S8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MEIS3P2A8K0S8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MEIS3P2A8K0S8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MEIS3P2A8K0S8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms