Protein–RNA interactions for Protein: A6NIK2

LRRC10B, Leucine-rich repeat-containing protein 10B, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC10BA6NIK2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC10BA6NIK2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC10BA6NIK2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC10BA6NIK2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC10BA6NIK2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC10BA6NIK2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC10BA6NIK2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC10BA6NIK2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC10BA6NIK2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC10BA6NIK2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC10BA6NIK2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC10BA6NIK2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC10BA6NIK2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC10BA6NIK2 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC10BA6NIK2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC10BA6NIK2 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC10BA6NIK2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms