Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms