Protein–RNA interactions for Protein: A6NI47

POTEM, Putative POTE ankyrin domain family member M, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEMA6NI47 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POTEMA6NI47 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POTEMA6NI47 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POTEMA6NI47 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POTEMA6NI47 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POTEMA6NI47 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POTEMA6NI47 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POTEMA6NI47 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POTEMA6NI47 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POTEMA6NI47 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POTEMA6NI47 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POTEMA6NI47 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POTEMA6NI47 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POTEMA6NI47 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POTEMA6NI47 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POTEMA6NI47 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POTEMA6NI47 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POTEMA6NI47 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POTEMA6NI47 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POTEMA6NI47 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POTEMA6NI47 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POTEMA6NI47 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POTEMA6NI47 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POTEMA6NI47 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POTEMA6NI47 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POTEMA6NI47 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POTEMA6NI47 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POTEMA6NI47 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POTEMA6NI47 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POTEMA6NI47 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
POTEMA6NI47 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POTEMA6NI47 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POTEMA6NI47 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POTEMA6NI47 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POTEMA6NI47 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POTEMA6NI47 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POTEMA6NI47 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POTEMA6NI47 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POTEMA6NI47 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POTEMA6NI47 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POTEMA6NI47 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POTEMA6NI47 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POTEMA6NI47 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POTEMA6NI47 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POTEMA6NI47 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POTEMA6NI47 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
POTEMA6NI47 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POTEMA6NI47 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POTEMA6NI47 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POTEMA6NI47 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POTEMA6NI47 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POTEMA6NI47 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POTEMA6NI47 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POTEMA6NI47 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POTEMA6NI47 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POTEMA6NI47 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POTEMA6NI47 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POTEMA6NI47 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POTEMA6NI47 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
POTEMA6NI47 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POTEMA6NI47 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POTEMA6NI47 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POTEMA6NI47 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POTEMA6NI47 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POTEMA6NI47 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POTEMA6NI47 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POTEMA6NI47 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POTEMA6NI47 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POTEMA6NI47 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POTEMA6NI47 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
POTEMA6NI47 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POTEMA6NI47 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POTEMA6NI47 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POTEMA6NI47 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
POTEMA6NI47 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POTEMA6NI47 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POTEMA6NI47 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POTEMA6NI47 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POTEMA6NI47 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POTEMA6NI47 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POTEMA6NI47 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POTEMA6NI47 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POTEMA6NI47 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POTEMA6NI47 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POTEMA6NI47 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POTEMA6NI47 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POTEMA6NI47 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
POTEMA6NI47 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POTEMA6NI47 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
POTEMA6NI47 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POTEMA6NI47 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POTEMA6NI47 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POTEMA6NI47 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POTEMA6NI47 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POTEMA6NI47 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POTEMA6NI47 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POTEMA6NI47 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POTEMA6NI47 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POTEMA6NI47 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POTEMA6NI47 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms