Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SERINC4A6NH21 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SERINC4A6NH21 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SERINC4A6NH21 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SERINC4A6NH21 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SERINC4A6NH21 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SERINC4A6NH21 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SERINC4A6NH21 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SERINC4A6NH21 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SERINC4A6NH21 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SERINC4A6NH21 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SERINC4A6NH21 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SERINC4A6NH21 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SERINC4A6NH21 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SERINC4A6NH21 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SERINC4A6NH21 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SERINC4A6NH21 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SERINC4A6NH21 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SERINC4A6NH21 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SERINC4A6NH21 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SERINC4A6NH21 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SERINC4A6NH21 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SERINC4A6NH21 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SERINC4A6NH21 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SERINC4A6NH21 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SERINC4A6NH21 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SERINC4A6NH21 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SERINC4A6NH21 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SERINC4A6NH21 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SERINC4A6NH21 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SERINC4A6NH21 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SERINC4A6NH21 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SERINC4A6NH21 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SERINC4A6NH21 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SERINC4A6NH21 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SERINC4A6NH21 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SERINC4A6NH21 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SERINC4A6NH21 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SERINC4A6NH21 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SERINC4A6NH21 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SERINC4A6NH21 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SERINC4A6NH21 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SERINC4A6NH21 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SERINC4A6NH21 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SERINC4A6NH21 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SERINC4A6NH21 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SERINC4A6NH21 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SERINC4A6NH21 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SERINC4A6NH21 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SERINC4A6NH21 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SERINC4A6NH21 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SERINC4A6NH21 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SERINC4A6NH21 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SERINC4A6NH21 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SERINC4A6NH21 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SERINC4A6NH21 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SERINC4A6NH21 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SERINC4A6NH21 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SERINC4A6NH21 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SERINC4A6NH21 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SERINC4A6NH21 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SERINC4A6NH21 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SERINC4A6NH21 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SERINC4A6NH21 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SERINC4A6NH21 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SERINC4A6NH21 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SERINC4A6NH21 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SERINC4A6NH21 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SERINC4A6NH21 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SERINC4A6NH21 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SERINC4A6NH21 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SERINC4A6NH21 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SERINC4A6NH21 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SERINC4A6NH21 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SERINC4A6NH21 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SERINC4A6NH21 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms