Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA6L4A6NEF3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA6L4A6NEF3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA6L4A6NEF3 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA6L4A6NEF3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA6L4A6NEF3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOLGA6L4A6NEF3 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOLGA6L4A6NEF3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOLGA6L4A6NEF3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOLGA6L4A6NEF3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GOLGA6L4A6NEF3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GOLGA6L4A6NEF3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOLGA6L4A6NEF3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOLGA6L4A6NEF3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOLGA6L4A6NEF3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOLGA6L4A6NEF3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOLGA6L4A6NEF3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOLGA6L4A6NEF3 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GOLGA6L4A6NEF3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOLGA6L4A6NEF3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOLGA6L4A6NEF3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GOLGA6L4A6NEF3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GOLGA6L4A6NEF3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GOLGA6L4A6NEF3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GOLGA6L4A6NEF3 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GOLGA6L4A6NEF3 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GOLGA6L4A6NEF3 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GOLGA6L4A6NEF3 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GOLGA6L4A6NEF3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GOLGA6L4A6NEF3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GOLGA6L4A6NEF3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GOLGA6L4A6NEF3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GOLGA6L4A6NEF3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GOLGA6L4A6NEF3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GOLGA6L4A6NEF3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GOLGA6L4A6NEF3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GOLGA6L4A6NEF3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GOLGA6L4A6NEF3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GOLGA6L4A6NEF3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GOLGA6L4A6NEF3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GOLGA6L4A6NEF3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GOLGA6L4A6NEF3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GOLGA6L4A6NEF3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GOLGA6L4A6NEF3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GOLGA6L4A6NEF3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GOLGA6L4A6NEF3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GOLGA6L4A6NEF3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GOLGA6L4A6NEF3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GOLGA6L4A6NEF3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GOLGA6L4A6NEF3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GOLGA6L4A6NEF3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GOLGA6L4A6NEF3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GOLGA6L4A6NEF3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GOLGA6L4A6NEF3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GOLGA6L4A6NEF3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GOLGA6L4A6NEF3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GOLGA6L4A6NEF3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GOLGA6L4A6NEF3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GOLGA6L4A6NEF3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GOLGA6L4A6NEF3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GOLGA6L4A6NEF3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GOLGA6L4A6NEF3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GOLGA6L4A6NEF3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GOLGA6L4A6NEF3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GOLGA6L4A6NEF3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GOLGA6L4A6NEF3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GOLGA6L4A6NEF3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GOLGA6L4A6NEF3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GOLGA6L4A6NEF3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GOLGA6L4A6NEF3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GOLGA6L4A6NEF3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GOLGA6L4A6NEF3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GOLGA6L4A6NEF3 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GOLGA6L4A6NEF3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GOLGA6L4A6NEF3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GOLGA6L4A6NEF3 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GOLGA6L4A6NEF3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GOLGA6L4A6NEF3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GOLGA6L4A6NEF3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GOLGA6L4A6NEF3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GOLGA6L4A6NEF3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GOLGA6L4A6NEF3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GOLGA6L4A6NEF3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GOLGA6L4A6NEF3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GOLGA6L4A6NEF3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GOLGA6L4A6NEF3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GOLGA6L4A6NEF3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GOLGA6L4A6NEF3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GOLGA6L4A6NEF3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GOLGA6L4A6NEF3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GOLGA6L4A6NEF3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GOLGA6L4A6NEF3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GOLGA6L4A6NEF3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GOLGA6L4A6NEF3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GOLGA6L4A6NEF3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GOLGA6L4A6NEF3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GOLGA6L4A6NEF3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GOLGA6L4A6NEF3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms