Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL33A6NCF5 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms