Protein–RNA interactions for Protein: A5A3E0

POTEF, POTE ankyrin domain family member F, humanhuman

Predictions only

Length 1,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEFA5A3E0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POTEFA5A3E0 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POTEFA5A3E0 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POTEFA5A3E0 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POTEFA5A3E0 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
POTEFA5A3E0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POTEFA5A3E0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POTEFA5A3E0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POTEFA5A3E0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POTEFA5A3E0 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POTEFA5A3E0 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
POTEFA5A3E0 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POTEFA5A3E0 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POTEFA5A3E0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POTEFA5A3E0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POTEFA5A3E0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POTEFA5A3E0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POTEFA5A3E0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POTEFA5A3E0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POTEFA5A3E0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POTEFA5A3E0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POTEFA5A3E0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POTEFA5A3E0 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POTEFA5A3E0 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POTEFA5A3E0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POTEFA5A3E0 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
POTEFA5A3E0 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
POTEFA5A3E0 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POTEFA5A3E0 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
POTEFA5A3E0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
POTEFA5A3E0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POTEFA5A3E0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POTEFA5A3E0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POTEFA5A3E0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POTEFA5A3E0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POTEFA5A3E0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POTEFA5A3E0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POTEFA5A3E0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POTEFA5A3E0 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POTEFA5A3E0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POTEFA5A3E0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POTEFA5A3E0 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POTEFA5A3E0 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POTEFA5A3E0 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POTEFA5A3E0 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POTEFA5A3E0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POTEFA5A3E0 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POTEFA5A3E0 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POTEFA5A3E0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
POTEFA5A3E0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
POTEFA5A3E0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POTEFA5A3E0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POTEFA5A3E0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POTEFA5A3E0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POTEFA5A3E0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POTEFA5A3E0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POTEFA5A3E0 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POTEFA5A3E0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
POTEFA5A3E0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
POTEFA5A3E0 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POTEFA5A3E0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POTEFA5A3E0 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POTEFA5A3E0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POTEFA5A3E0 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POTEFA5A3E0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POTEFA5A3E0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
POTEFA5A3E0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
POTEFA5A3E0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
POTEFA5A3E0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
POTEFA5A3E0 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POTEFA5A3E0 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms