Protein–RNA interactions for Protein: A4D126

ISPD, D-ribitol-5-phosphate cytidylyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISPDA4D126 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ISPDA4D126 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ISPDA4D126 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ISPDA4D126 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ISPDA4D126 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ISPDA4D126 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ISPDA4D126 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ISPDA4D126 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ISPDA4D126 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ISPDA4D126 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ISPDA4D126 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ISPDA4D126 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ISPDA4D126 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ISPDA4D126 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ISPDA4D126 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ISPDA4D126 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ISPDA4D126 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ISPDA4D126 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ISPDA4D126 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ISPDA4D126 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ISPDA4D126 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ISPDA4D126 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ISPDA4D126 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ISPDA4D126 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ISPDA4D126 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ISPDA4D126 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ISPDA4D126 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ISPDA4D126 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ISPDA4D126 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ISPDA4D126 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ISPDA4D126 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ISPDA4D126 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ISPDA4D126 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ISPDA4D126 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ISPDA4D126 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ISPDA4D126 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ISPDA4D126 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ISPDA4D126 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ISPDA4D126 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ISPDA4D126 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ISPDA4D126 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ISPDA4D126 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ISPDA4D126 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ISPDA4D126 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ISPDA4D126 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ISPDA4D126 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ISPDA4D126 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ISPDA4D126 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ISPDA4D126 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ISPDA4D126 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ISPDA4D126 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ISPDA4D126 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ISPDA4D126 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ISPDA4D126 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ISPDA4D126 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ISPDA4D126 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ISPDA4D126 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ISPDA4D126 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ISPDA4D126 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ISPDA4D126 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ISPDA4D126 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ISPDA4D126 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ISPDA4D126 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ISPDA4D126 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ISPDA4D126 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ISPDA4D126 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ISPDA4D126 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ISPDA4D126 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ISPDA4D126 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ISPDA4D126 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ISPDA4D126 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ISPDA4D126 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ISPDA4D126 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ISPDA4D126 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ISPDA4D126 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ISPDA4D126 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ISPDA4D126 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ISPDA4D126 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ISPDA4D126 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ISPDA4D126 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ISPDA4D126 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ISPDA4D126 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ISPDA4D126 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ISPDA4D126 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ISPDA4D126 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ISPDA4D126 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ISPDA4D126 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ISPDA4D126 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ISPDA4D126 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ISPDA4D126 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ISPDA4D126 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ISPDA4D126 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ISPDA4D126 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ISPDA4D126 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ISPDA4D126 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ISPDA4D126 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ISPDA4D126 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ISPDA4D126 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ISPDA4D126 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ISPDA4D126 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms