Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YYL6

RPL17-C18orf32, Protein RPL17-C18orf32, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms