Protein–RNA interactions for Protein: S4R3F8

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S4R3F8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
S4R3F8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
S4R3F8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
S4R3F8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
S4R3F8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
S4R3F8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
S4R3F8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
S4R3F8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
S4R3F8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
S4R3F8 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
S4R3F8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
S4R3F8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
S4R3F8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
S4R3F8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
S4R3F8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
S4R3F8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
S4R3F8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
S4R3F8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
S4R3F8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
S4R3F8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
S4R3F8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
S4R3F8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
S4R3F8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
S4R3F8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
S4R3F8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
S4R3F8 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
S4R3F8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
S4R3F8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
S4R3F8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
S4R3F8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
S4R3F8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
S4R3F8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
S4R3F8 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
S4R3F8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
S4R3F8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
S4R3F8 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
S4R3F8 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
S4R3F8 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
S4R3F8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
S4R3F8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
S4R3F8 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
S4R3F8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
S4R3F8 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
S4R3F8 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
S4R3F8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
S4R3F8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
S4R3F8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
S4R3F8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
S4R3F8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
S4R3F8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
S4R3F8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
S4R3F8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
S4R3F8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
S4R3F8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
S4R3F8 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
S4R3F8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
S4R3F8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
S4R3F8 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
S4R3F8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
S4R3F8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
S4R3F8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
S4R3F8 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
S4R3F8 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
S4R3F8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
S4R3F8 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
S4R3F8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
S4R3F8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
S4R3F8 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
S4R3F8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
S4R3F8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
S4R3F8 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
S4R3F8 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
S4R3F8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
S4R3F8 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
S4R3F8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
S4R3F8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
S4R3F8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
S4R3F8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
S4R3F8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
S4R3F8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
S4R3F8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
S4R3F8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
S4R3F8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
S4R3F8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
S4R3F8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
S4R3F8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
S4R3F8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
S4R3F8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
S4R3F8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
S4R3F8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
S4R3F8 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
S4R3F8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
S4R3F8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
S4R3F8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
S4R3F8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
S4R3F8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
S4R3F8 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
S4R3F8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
S4R3F8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
S4R3F8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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