Protein–RNA interactions for Protein: R4GMQ9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R4GMQ9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
R4GMQ9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
R4GMQ9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
R4GMQ9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
R4GMQ9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
R4GMQ9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
R4GMQ9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
R4GMQ9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
R4GMQ9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
R4GMQ9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
R4GMQ9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
R4GMQ9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
R4GMQ9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
R4GMQ9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
R4GMQ9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
R4GMQ9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
R4GMQ9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
R4GMQ9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
R4GMQ9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
R4GMQ9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
R4GMQ9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
R4GMQ9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
R4GMQ9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
R4GMQ9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
R4GMQ9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
R4GMQ9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
R4GMQ9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
R4GMQ9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
R4GMQ9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
R4GMQ9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
R4GMQ9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
R4GMQ9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
R4GMQ9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
R4GMQ9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
R4GMQ9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
R4GMQ9 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
R4GMQ9 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
R4GMQ9 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
R4GMQ9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
R4GMQ9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
R4GMQ9 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
R4GMQ9 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
R4GMQ9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
R4GMQ9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
R4GMQ9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
R4GMQ9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
R4GMQ9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
R4GMQ9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
R4GMQ9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
R4GMQ9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
R4GMQ9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
R4GMQ9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
R4GMQ9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
R4GMQ9 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
R4GMQ9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
R4GMQ9 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
R4GMQ9 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
R4GMQ9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
R4GMQ9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
R4GMQ9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
R4GMQ9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
R4GMQ9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
R4GMQ9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
R4GMQ9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
R4GMQ9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
R4GMQ9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
R4GMQ9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
R4GMQ9 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
R4GMQ9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
R4GMQ9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
R4GMQ9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
R4GMQ9 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
R4GMQ9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
R4GMQ9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
R4GMQ9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
R4GMQ9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
R4GMQ9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
R4GMQ9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
R4GMQ9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
R4GMQ9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
R4GMQ9 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
R4GMQ9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
R4GMQ9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
R4GMQ9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
R4GMQ9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
R4GMQ9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
R4GMQ9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
R4GMQ9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
R4GMQ9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
R4GMQ9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
R4GMQ9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
R4GMQ9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
R4GMQ9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
R4GMQ9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
R4GMQ9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
R4GMQ9 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
R4GMQ9 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
R4GMQ9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
R4GMQ9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
R4GMQ9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms