Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC4A4Q9Y6R1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC4A4Q9Y6R1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC4A4Q9Y6R1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC4A4Q9Y6R1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC4A4Q9Y6R1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC4A4Q9Y6R1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC4A4Q9Y6R1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC4A4Q9Y6R1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC4A4Q9Y6R1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC4A4Q9Y6R1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC4A4Q9Y6R1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC4A4Q9Y6R1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC4A4Q9Y6R1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC4A4Q9Y6R1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC4A4Q9Y6R1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC4A4Q9Y6R1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC4A4Q9Y6R1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC4A4Q9Y6R1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC4A4Q9Y6R1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC4A4Q9Y6R1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC4A4Q9Y6R1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC4A4Q9Y6R1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC4A4Q9Y6R1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC4A4Q9Y6R1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC4A4Q9Y6R1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC4A4Q9Y6R1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC4A4Q9Y6R1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC4A4Q9Y6R1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC4A4Q9Y6R1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC4A4Q9Y6R1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC4A4Q9Y6R1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC4A4Q9Y6R1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC4A4Q9Y6R1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC4A4Q9Y6R1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC4A4Q9Y6R1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC4A4Q9Y6R1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC4A4Q9Y6R1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC4A4Q9Y6R1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC4A4Q9Y6R1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC4A4Q9Y6R1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC4A4Q9Y6R1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC4A4Q9Y6R1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC4A4Q9Y6R1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC4A4Q9Y6R1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC4A4Q9Y6R1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC4A4Q9Y6R1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC4A4Q9Y6R1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC4A4Q9Y6R1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC4A4Q9Y6R1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC4A4Q9Y6R1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC4A4Q9Y6R1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC4A4Q9Y6R1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC4A4Q9Y6R1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC4A4Q9Y6R1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC4A4Q9Y6R1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC4A4Q9Y6R1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC4A4Q9Y6R1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC4A4Q9Y6R1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC4A4Q9Y6R1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC4A4Q9Y6R1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC4A4Q9Y6R1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC4A4Q9Y6R1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC4A4Q9Y6R1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC4A4Q9Y6R1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC4A4Q9Y6R1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC4A4Q9Y6R1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC4A4Q9Y6R1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC4A4Q9Y6R1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC4A4Q9Y6R1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC4A4Q9Y6R1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC4A4Q9Y6R1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC4A4Q9Y6R1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC4A4Q9Y6R1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC4A4Q9Y6R1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC4A4Q9Y6R1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC4A4Q9Y6R1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC4A4Q9Y6R1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC4A4Q9Y6R1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC4A4Q9Y6R1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC4A4Q9Y6R1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SLC4A4Q9Y6R1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SLC4A4Q9Y6R1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC4A4Q9Y6R1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC4A4Q9Y6R1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC4A4Q9Y6R1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC4A4Q9Y6R1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC4A4Q9Y6R1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC4A4Q9Y6R1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC4A4Q9Y6R1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC4A4Q9Y6R1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC4A4Q9Y6R1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC4A4Q9Y6R1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC4A4Q9Y6R1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC4A4Q9Y6R1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC4A4Q9Y6R1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms