Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD54BQ9Y620 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD54BQ9Y620 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD54BQ9Y620 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD54BQ9Y620 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD54BQ9Y620 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD54BQ9Y620 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD54BQ9Y620 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD54BQ9Y620 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD54BQ9Y620 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD54BQ9Y620 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD54BQ9Y620 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD54BQ9Y620 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD54BQ9Y620 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD54BQ9Y620 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD54BQ9Y620 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD54BQ9Y620 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD54BQ9Y620 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD54BQ9Y620 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD54BQ9Y620 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD54BQ9Y620 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD54BQ9Y620 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD54BQ9Y620 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD54BQ9Y620 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD54BQ9Y620 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD54BQ9Y620 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD54BQ9Y620 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD54BQ9Y620 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD54BQ9Y620 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD54BQ9Y620 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD54BQ9Y620 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD54BQ9Y620 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD54BQ9Y620 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD54BQ9Y620 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD54BQ9Y620 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD54BQ9Y620 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD54BQ9Y620 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD54BQ9Y620 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD54BQ9Y620 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD54BQ9Y620 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD54BQ9Y620 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD54BQ9Y620 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD54BQ9Y620 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD54BQ9Y620 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD54BQ9Y620 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD54BQ9Y620 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD54BQ9Y620 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD54BQ9Y620 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD54BQ9Y620 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
RAD54BQ9Y620 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RAD54BQ9Y620 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAD54BQ9Y620 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAD54BQ9Y620 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAD54BQ9Y620 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAD54BQ9Y620 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAD54BQ9Y620 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAD54BQ9Y620 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAD54BQ9Y620 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAD54BQ9Y620 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAD54BQ9Y620 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAD54BQ9Y620 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAD54BQ9Y620 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAD54BQ9Y620 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAD54BQ9Y620 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAD54BQ9Y620 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAD54BQ9Y620 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAD54BQ9Y620 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAD54BQ9Y620 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAD54BQ9Y620 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAD54BQ9Y620 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAD54BQ9Y620 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAD54BQ9Y620 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAD54BQ9Y620 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAD54BQ9Y620 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAD54BQ9Y620 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAD54BQ9Y620 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RAD54BQ9Y620 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RAD54BQ9Y620 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAD54BQ9Y620 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAD54BQ9Y620 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAD54BQ9Y620 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAD54BQ9Y620 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAD54BQ9Y620 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RAD54BQ9Y620 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAD54BQ9Y620 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAD54BQ9Y620 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAD54BQ9Y620 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAD54BQ9Y620 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAD54BQ9Y620 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAD54BQ9Y620 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAD54BQ9Y620 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAD54BQ9Y620 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAD54BQ9Y620 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAD54BQ9Y620 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAD54BQ9Y620 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAD54BQ9Y620 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAD54BQ9Y620 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAD54BQ9Y620 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAD54BQ9Y620 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAD54BQ9Y620 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms