Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP16Q9Y5T5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP16Q9Y5T5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP16Q9Y5T5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP16Q9Y5T5 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP16Q9Y5T5 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP16Q9Y5T5 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP16Q9Y5T5 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP16Q9Y5T5 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP16Q9Y5T5 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
USP16Q9Y5T5 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP16Q9Y5T5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP16Q9Y5T5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP16Q9Y5T5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP16Q9Y5T5 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
USP16Q9Y5T5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP16Q9Y5T5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP16Q9Y5T5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP16Q9Y5T5 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP16Q9Y5T5 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP16Q9Y5T5 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP16Q9Y5T5 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP16Q9Y5T5 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP16Q9Y5T5 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP16Q9Y5T5 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
USP16Q9Y5T5 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP16Q9Y5T5 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP16Q9Y5T5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP16Q9Y5T5 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP16Q9Y5T5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP16Q9Y5T5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP16Q9Y5T5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP16Q9Y5T5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP16Q9Y5T5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP16Q9Y5T5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP16Q9Y5T5 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP16Q9Y5T5 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
USP16Q9Y5T5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP16Q9Y5T5 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP16Q9Y5T5 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP16Q9Y5T5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP16Q9Y5T5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP16Q9Y5T5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP16Q9Y5T5 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
USP16Q9Y5T5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP16Q9Y5T5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP16Q9Y5T5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP16Q9Y5T5 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP16Q9Y5T5 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP16Q9Y5T5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP16Q9Y5T5 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP16Q9Y5T5 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP16Q9Y5T5 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP16Q9Y5T5 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP16Q9Y5T5 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP16Q9Y5T5 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP16Q9Y5T5 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP16Q9Y5T5 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP16Q9Y5T5 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP16Q9Y5T5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP16Q9Y5T5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP16Q9Y5T5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP16Q9Y5T5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP16Q9Y5T5 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP16Q9Y5T5 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
USP16Q9Y5T5 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP16Q9Y5T5 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
USP16Q9Y5T5 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP16Q9Y5T5 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP16Q9Y5T5 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP16Q9Y5T5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP16Q9Y5T5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP16Q9Y5T5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP16Q9Y5T5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP16Q9Y5T5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP16Q9Y5T5 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP16Q9Y5T5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
USP16Q9Y5T5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP16Q9Y5T5 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP16Q9Y5T5 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP16Q9Y5T5 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP16Q9Y5T5 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP16Q9Y5T5 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP16Q9Y5T5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP16Q9Y5T5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP16Q9Y5T5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP16Q9Y5T5 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP16Q9Y5T5 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP16Q9Y5T5 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP16Q9Y5T5 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP16Q9Y5T5 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP16Q9Y5T5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP16Q9Y5T5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP16Q9Y5T5 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP16Q9Y5T5 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP16Q9Y5T5 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
USP16Q9Y5T5 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP16Q9Y5T5 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP16Q9Y5T5 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP16Q9Y5T5 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms