Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5F1

PCDHB12, Protocadherin beta-12, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB12Q9Y5F1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB12Q9Y5F1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB12Q9Y5F1 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB12Q9Y5F1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB12Q9Y5F1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB12Q9Y5F1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB12Q9Y5F1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB12Q9Y5F1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB12Q9Y5F1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB12Q9Y5F1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB12Q9Y5F1 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB12Q9Y5F1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB12Q9Y5F1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB12Q9Y5F1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB12Q9Y5F1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB12Q9Y5F1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB12Q9Y5F1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB12Q9Y5F1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB12Q9Y5F1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB12Q9Y5F1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB12Q9Y5F1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB12Q9Y5F1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB12Q9Y5F1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB12Q9Y5F1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB12Q9Y5F1 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB12Q9Y5F1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB12Q9Y5F1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB12Q9Y5F1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB12Q9Y5F1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB12Q9Y5F1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB12Q9Y5F1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB12Q9Y5F1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB12Q9Y5F1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB12Q9Y5F1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB12Q9Y5F1 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB12Q9Y5F1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB12Q9Y5F1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB12Q9Y5F1 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB12Q9Y5F1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB12Q9Y5F1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB12Q9Y5F1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB12Q9Y5F1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB12Q9Y5F1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB12Q9Y5F1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB12Q9Y5F1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB12Q9Y5F1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB12Q9Y5F1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB12Q9Y5F1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB12Q9Y5F1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB12Q9Y5F1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB12Q9Y5F1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB12Q9Y5F1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB12Q9Y5F1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB12Q9Y5F1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB12Q9Y5F1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB12Q9Y5F1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB12Q9Y5F1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB12Q9Y5F1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB12Q9Y5F1 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB12Q9Y5F1 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB12Q9Y5F1 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB12Q9Y5F1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB12Q9Y5F1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB12Q9Y5F1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB12Q9Y5F1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB12Q9Y5F1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB12Q9Y5F1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB12Q9Y5F1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB12Q9Y5F1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB12Q9Y5F1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB12Q9Y5F1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB12Q9Y5F1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB12Q9Y5F1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB12Q9Y5F1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB12Q9Y5F1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB12Q9Y5F1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB12Q9Y5F1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB12Q9Y5F1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB12Q9Y5F1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB12Q9Y5F1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB12Q9Y5F1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB12Q9Y5F1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB12Q9Y5F1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB12Q9Y5F1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB12Q9Y5F1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB12Q9Y5F1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB12Q9Y5F1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB12Q9Y5F1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB12Q9Y5F1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB12Q9Y5F1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB12Q9Y5F1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB12Q9Y5F1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB12Q9Y5F1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB12Q9Y5F1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB12Q9Y5F1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB12Q9Y5F1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB12Q9Y5F1 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB12Q9Y5F1 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB12Q9Y5F1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB12Q9Y5F1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms