Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B4

RAD54L2, Helicase ARIP4, humanhuman

Predictions only

Length 1,467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54L2Q9Y4B4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
RAD54L2Q9Y4B4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
RAD54L2Q9Y4B4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
RAD54L2Q9Y4B4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
RAD54L2Q9Y4B4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
RAD54L2Q9Y4B4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
RAD54L2Q9Y4B4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC35.61■■■■□ 3.29
RAD54L2Q9Y4B4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
RAD54L2Q9Y4B4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
RAD54L2Q9Y4B4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
RAD54L2Q9Y4B4 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
RAD54L2Q9Y4B4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
RAD54L2Q9Y4B4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
RAD54L2Q9Y4B4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
RAD54L2Q9Y4B4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
RAD54L2Q9Y4B4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
RAD54L2Q9Y4B4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
RAD54L2Q9Y4B4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
RAD54L2Q9Y4B4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
RAD54L2Q9Y4B4 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
RAD54L2Q9Y4B4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
RAD54L2Q9Y4B4 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
RAD54L2Q9Y4B4 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
RAD54L2Q9Y4B4 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
RAD54L2Q9Y4B4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
RAD54L2Q9Y4B4 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
RAD54L2Q9Y4B4 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
RAD54L2Q9Y4B4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
RAD54L2Q9Y4B4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
RAD54L2Q9Y4B4 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
RAD54L2Q9Y4B4 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
RAD54L2Q9Y4B4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
RAD54L2Q9Y4B4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.58■■■■□ 3.29
RAD54L2Q9Y4B4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
RAD54L2Q9Y4B4 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
RAD54L2Q9Y4B4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.58■■■■□ 3.29
RAD54L2Q9Y4B4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
RAD54L2Q9Y4B4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
RAD54L2Q9Y4B4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
RAD54L2Q9Y4B4 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
RAD54L2Q9Y4B4 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
RAD54L2Q9Y4B4 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
RAD54L2Q9Y4B4 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
RAD54L2Q9Y4B4 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
RAD54L2Q9Y4B4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
RAD54L2Q9Y4B4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
RAD54L2Q9Y4B4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
RAD54L2Q9Y4B4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC35.56■■■■□ 3.28
RAD54L2Q9Y4B4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
RAD54L2Q9Y4B4 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
RAD54L2Q9Y4B4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
RAD54L2Q9Y4B4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
RAD54L2Q9Y4B4 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC35.55■■■■□ 3.28
RAD54L2Q9Y4B4 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
RAD54L2Q9Y4B4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
RAD54L2Q9Y4B4 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
RAD54L2Q9Y4B4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
RAD54L2Q9Y4B4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
RAD54L2Q9Y4B4 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
RAD54L2Q9Y4B4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
RAD54L2Q9Y4B4 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
RAD54L2Q9Y4B4 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
RAD54L2Q9Y4B4 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
RAD54L2Q9Y4B4 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC35.54■■■■□ 3.28
RAD54L2Q9Y4B4 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
RAD54L2Q9Y4B4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
RAD54L2Q9Y4B4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
RAD54L2Q9Y4B4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
RAD54L2Q9Y4B4 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
RAD54L2Q9Y4B4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
RAD54L2Q9Y4B4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
RAD54L2Q9Y4B4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
RAD54L2Q9Y4B4 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
RAD54L2Q9Y4B4 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
RAD54L2Q9Y4B4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
RAD54L2Q9Y4B4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
RAD54L2Q9Y4B4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
RAD54L2Q9Y4B4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
RAD54L2Q9Y4B4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
RAD54L2Q9Y4B4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
RAD54L2Q9Y4B4 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
RAD54L2Q9Y4B4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
RAD54L2Q9Y4B4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
RAD54L2Q9Y4B4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
RAD54L2Q9Y4B4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
RAD54L2Q9Y4B4 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
RAD54L2Q9Y4B4 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
RAD54L2Q9Y4B4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
RAD54L2Q9Y4B4 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
RAD54L2Q9Y4B4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
RAD54L2Q9Y4B4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
RAD54L2Q9Y4B4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
RAD54L2Q9Y4B4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
RAD54L2Q9Y4B4 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
RAD54L2Q9Y4B4 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
RAD54L2Q9Y4B4 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms