Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms