Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T7

YBX2, Y-box-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX2Q9Y2T7 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
YBX2Q9Y2T7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
YBX2Q9Y2T7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
YBX2Q9Y2T7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
YBX2Q9Y2T7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
YBX2Q9Y2T7 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
YBX2Q9Y2T7 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
YBX2Q9Y2T7 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
YBX2Q9Y2T7 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
YBX2Q9Y2T7 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
YBX2Q9Y2T7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
YBX2Q9Y2T7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
YBX2Q9Y2T7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
YBX2Q9Y2T7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
YBX2Q9Y2T7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
YBX2Q9Y2T7 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
YBX2Q9Y2T7 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
YBX2Q9Y2T7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
YBX2Q9Y2T7 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
YBX2Q9Y2T7 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
YBX2Q9Y2T7 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
YBX2Q9Y2T7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
YBX2Q9Y2T7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
YBX2Q9Y2T7 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
YBX2Q9Y2T7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
YBX2Q9Y2T7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
YBX2Q9Y2T7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
YBX2Q9Y2T7 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
YBX2Q9Y2T7 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
YBX2Q9Y2T7 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
YBX2Q9Y2T7 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
YBX2Q9Y2T7 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
YBX2Q9Y2T7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
YBX2Q9Y2T7 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
YBX2Q9Y2T7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
YBX2Q9Y2T7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
YBX2Q9Y2T7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
YBX2Q9Y2T7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
YBX2Q9Y2T7 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
YBX2Q9Y2T7 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
YBX2Q9Y2T7 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
YBX2Q9Y2T7 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
YBX2Q9Y2T7 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
YBX2Q9Y2T7 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
YBX2Q9Y2T7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
YBX2Q9Y2T7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
YBX2Q9Y2T7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
YBX2Q9Y2T7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
YBX2Q9Y2T7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
YBX2Q9Y2T7 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
YBX2Q9Y2T7 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
YBX2Q9Y2T7 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
YBX2Q9Y2T7 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
YBX2Q9Y2T7 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
YBX2Q9Y2T7 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
YBX2Q9Y2T7 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
YBX2Q9Y2T7 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
YBX2Q9Y2T7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
YBX2Q9Y2T7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
YBX2Q9Y2T7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
YBX2Q9Y2T7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
YBX2Q9Y2T7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
YBX2Q9Y2T7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
YBX2Q9Y2T7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
YBX2Q9Y2T7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
YBX2Q9Y2T7 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
YBX2Q9Y2T7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
YBX2Q9Y2T7 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
YBX2Q9Y2T7 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
YBX2Q9Y2T7 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
YBX2Q9Y2T7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
YBX2Q9Y2T7 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
YBX2Q9Y2T7 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
YBX2Q9Y2T7 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
YBX2Q9Y2T7 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
YBX2Q9Y2T7 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
YBX2Q9Y2T7 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
YBX2Q9Y2T7 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
YBX2Q9Y2T7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
YBX2Q9Y2T7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
YBX2Q9Y2T7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
YBX2Q9Y2T7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
YBX2Q9Y2T7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
YBX2Q9Y2T7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
YBX2Q9Y2T7 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
YBX2Q9Y2T7 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
YBX2Q9Y2T7 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
YBX2Q9Y2T7 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
YBX2Q9Y2T7 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
YBX2Q9Y2T7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
YBX2Q9Y2T7 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
YBX2Q9Y2T7 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
YBX2Q9Y2T7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
YBX2Q9Y2T7 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
YBX2Q9Y2T7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
YBX2Q9Y2T7 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
YBX2Q9Y2T7 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
YBX2Q9Y2T7 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
YBX2Q9Y2T7 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
YBX2Q9Y2T7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms