Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TRAPPC8Q9Y2L5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TRAPPC8Q9Y2L5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TRAPPC8Q9Y2L5 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TRAPPC8Q9Y2L5 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TRAPPC8Q9Y2L5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TRAPPC8Q9Y2L5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TRAPPC8Q9Y2L5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TRAPPC8Q9Y2L5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TRAPPC8Q9Y2L5 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TRAPPC8Q9Y2L5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TRAPPC8Q9Y2L5 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TRAPPC8Q9Y2L5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TRAPPC8Q9Y2L5 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TRAPPC8Q9Y2L5 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TRAPPC8Q9Y2L5 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
TRAPPC8Q9Y2L5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TRAPPC8Q9Y2L5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TRAPPC8Q9Y2L5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TRAPPC8Q9Y2L5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TRAPPC8Q9Y2L5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
TRAPPC8Q9Y2L5 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TRAPPC8Q9Y2L5 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
TRAPPC8Q9Y2L5 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TRAPPC8Q9Y2L5 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
TRAPPC8Q9Y2L5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TRAPPC8Q9Y2L5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TRAPPC8Q9Y2L5 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
TRAPPC8Q9Y2L5 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
TRAPPC8Q9Y2L5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
TRAPPC8Q9Y2L5 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
TRAPPC8Q9Y2L5 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
TRAPPC8Q9Y2L5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
TRAPPC8Q9Y2L5 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
TRAPPC8Q9Y2L5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
TRAPPC8Q9Y2L5 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
TRAPPC8Q9Y2L5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
TRAPPC8Q9Y2L5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC32.01■■■□□ 2.71
TRAPPC8Q9Y2L5 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC32■■■□□ 2.71
TRAPPC8Q9Y2L5 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
TRAPPC8Q9Y2L5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
TRAPPC8Q9Y2L5 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
TRAPPC8Q9Y2L5 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
TRAPPC8Q9Y2L5 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
TRAPPC8Q9Y2L5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
TRAPPC8Q9Y2L5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
TRAPPC8Q9Y2L5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
TRAPPC8Q9Y2L5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
TRAPPC8Q9Y2L5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
TRAPPC8Q9Y2L5 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
TRAPPC8Q9Y2L5 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
TRAPPC8Q9Y2L5 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
TRAPPC8Q9Y2L5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
TRAPPC8Q9Y2L5 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
TRAPPC8Q9Y2L5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
TRAPPC8Q9Y2L5 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
TRAPPC8Q9Y2L5 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
TRAPPC8Q9Y2L5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
TRAPPC8Q9Y2L5 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
TRAPPC8Q9Y2L5 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
TRAPPC8Q9Y2L5 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
TRAPPC8Q9Y2L5 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
TRAPPC8Q9Y2L5 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
TRAPPC8Q9Y2L5 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
TRAPPC8Q9Y2L5 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
TRAPPC8Q9Y2L5 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
TRAPPC8Q9Y2L5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
TRAPPC8Q9Y2L5 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
TRAPPC8Q9Y2L5 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
TRAPPC8Q9Y2L5 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
TRAPPC8Q9Y2L5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
TRAPPC8Q9Y2L5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
TRAPPC8Q9Y2L5 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
TRAPPC8Q9Y2L5 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
TRAPPC8Q9Y2L5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
TRAPPC8Q9Y2L5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
TRAPPC8Q9Y2L5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.7
TRAPPC8Q9Y2L5 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
TRAPPC8Q9Y2L5 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
TRAPPC8Q9Y2L5 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
TRAPPC8Q9Y2L5 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.94■■■□□ 2.7
TRAPPC8Q9Y2L5 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
TRAPPC8Q9Y2L5 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
TRAPPC8Q9Y2L5 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC31.93■■■□□ 2.7
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC31.93■■■□□ 2.7
TRAPPC8Q9Y2L5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
TRAPPC8Q9Y2L5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms