Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
USP20Q9Y2K6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP20Q9Y2K6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP20Q9Y2K6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
USP20Q9Y2K6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP20Q9Y2K6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP20Q9Y2K6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP20Q9Y2K6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP20Q9Y2K6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP20Q9Y2K6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP20Q9Y2K6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP20Q9Y2K6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP20Q9Y2K6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP20Q9Y2K6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP20Q9Y2K6 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP20Q9Y2K6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP20Q9Y2K6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
USP20Q9Y2K6 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
USP20Q9Y2K6 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP20Q9Y2K6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP20Q9Y2K6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
USP20Q9Y2K6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP20Q9Y2K6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP20Q9Y2K6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP20Q9Y2K6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP20Q9Y2K6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP20Q9Y2K6 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP20Q9Y2K6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP20Q9Y2K6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP20Q9Y2K6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP20Q9Y2K6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP20Q9Y2K6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP20Q9Y2K6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP20Q9Y2K6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP20Q9Y2K6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP20Q9Y2K6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
USP20Q9Y2K6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP20Q9Y2K6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP20Q9Y2K6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP20Q9Y2K6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP20Q9Y2K6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP20Q9Y2K6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP20Q9Y2K6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP20Q9Y2K6 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP20Q9Y2K6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP20Q9Y2K6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP20Q9Y2K6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP20Q9Y2K6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP20Q9Y2K6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP20Q9Y2K6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP20Q9Y2K6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
USP20Q9Y2K6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP20Q9Y2K6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP20Q9Y2K6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP20Q9Y2K6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP20Q9Y2K6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP20Q9Y2K6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP20Q9Y2K6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP20Q9Y2K6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP20Q9Y2K6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP20Q9Y2K6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP20Q9Y2K6 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP20Q9Y2K6 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
USP20Q9Y2K6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
USP20Q9Y2K6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
USP20Q9Y2K6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP20Q9Y2K6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP20Q9Y2K6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP20Q9Y2K6 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP20Q9Y2K6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP20Q9Y2K6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP20Q9Y2K6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP20Q9Y2K6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP20Q9Y2K6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP20Q9Y2K6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP20Q9Y2K6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP20Q9Y2K6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP20Q9Y2K6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP20Q9Y2K6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP20Q9Y2K6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP20Q9Y2K6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP20Q9Y2K6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP20Q9Y2K6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
USP20Q9Y2K6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP20Q9Y2K6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP20Q9Y2K6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP20Q9Y2K6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP20Q9Y2K6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP20Q9Y2K6 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms