Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ52

CNTN6, Contactin-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN6Q9UQ52 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTN6Q9UQ52 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTN6Q9UQ52 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTN6Q9UQ52 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CNTN6Q9UQ52 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTN6Q9UQ52 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTN6Q9UQ52 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTN6Q9UQ52 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTN6Q9UQ52 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTN6Q9UQ52 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTN6Q9UQ52 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTN6Q9UQ52 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTN6Q9UQ52 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTN6Q9UQ52 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTN6Q9UQ52 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTN6Q9UQ52 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTN6Q9UQ52 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTN6Q9UQ52 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTN6Q9UQ52 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTN6Q9UQ52 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTN6Q9UQ52 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTN6Q9UQ52 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTN6Q9UQ52 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTN6Q9UQ52 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTN6Q9UQ52 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTN6Q9UQ52 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTN6Q9UQ52 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTN6Q9UQ52 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTN6Q9UQ52 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTN6Q9UQ52 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTN6Q9UQ52 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTN6Q9UQ52 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTN6Q9UQ52 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTN6Q9UQ52 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTN6Q9UQ52 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTN6Q9UQ52 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTN6Q9UQ52 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTN6Q9UQ52 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTN6Q9UQ52 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTN6Q9UQ52 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTN6Q9UQ52 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTN6Q9UQ52 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTN6Q9UQ52 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTN6Q9UQ52 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTN6Q9UQ52 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTN6Q9UQ52 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTN6Q9UQ52 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTN6Q9UQ52 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTN6Q9UQ52 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTN6Q9UQ52 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTN6Q9UQ52 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTN6Q9UQ52 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTN6Q9UQ52 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTN6Q9UQ52 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTN6Q9UQ52 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTN6Q9UQ52 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTN6Q9UQ52 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTN6Q9UQ52 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTN6Q9UQ52 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTN6Q9UQ52 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTN6Q9UQ52 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTN6Q9UQ52 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTN6Q9UQ52 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTN6Q9UQ52 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTN6Q9UQ52 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTN6Q9UQ52 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTN6Q9UQ52 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTN6Q9UQ52 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTN6Q9UQ52 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTN6Q9UQ52 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTN6Q9UQ52 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTN6Q9UQ52 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTN6Q9UQ52 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTN6Q9UQ52 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTN6Q9UQ52 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTN6Q9UQ52 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTN6Q9UQ52 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTN6Q9UQ52 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTN6Q9UQ52 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTN6Q9UQ52 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTN6Q9UQ52 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTN6Q9UQ52 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTN6Q9UQ52 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTN6Q9UQ52 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTN6Q9UQ52 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTN6Q9UQ52 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTN6Q9UQ52 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTN6Q9UQ52 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CNTN6Q9UQ52 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CNTN6Q9UQ52 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms