Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AGAP1Q9UPQ3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AGAP1Q9UPQ3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
AGAP1Q9UPQ3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AGAP1Q9UPQ3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AGAP1Q9UPQ3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AGAP1Q9UPQ3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AGAP1Q9UPQ3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AGAP1Q9UPQ3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AGAP1Q9UPQ3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AGAP1Q9UPQ3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AGAP1Q9UPQ3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AGAP1Q9UPQ3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AGAP1Q9UPQ3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AGAP1Q9UPQ3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AGAP1Q9UPQ3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AGAP1Q9UPQ3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AGAP1Q9UPQ3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AGAP1Q9UPQ3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
AGAP1Q9UPQ3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AGAP1Q9UPQ3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AGAP1Q9UPQ3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AGAP1Q9UPQ3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AGAP1Q9UPQ3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AGAP1Q9UPQ3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AGAP1Q9UPQ3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AGAP1Q9UPQ3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AGAP1Q9UPQ3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AGAP1Q9UPQ3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AGAP1Q9UPQ3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
AGAP1Q9UPQ3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AGAP1Q9UPQ3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
AGAP1Q9UPQ3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AGAP1Q9UPQ3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
AGAP1Q9UPQ3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AGAP1Q9UPQ3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AGAP1Q9UPQ3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AGAP1Q9UPQ3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AGAP1Q9UPQ3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AGAP1Q9UPQ3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
AGAP1Q9UPQ3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AGAP1Q9UPQ3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AGAP1Q9UPQ3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AGAP1Q9UPQ3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AGAP1Q9UPQ3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AGAP1Q9UPQ3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AGAP1Q9UPQ3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AGAP1Q9UPQ3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AGAP1Q9UPQ3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
AGAP1Q9UPQ3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
AGAP1Q9UPQ3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AGAP1Q9UPQ3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AGAP1Q9UPQ3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AGAP1Q9UPQ3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AGAP1Q9UPQ3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AGAP1Q9UPQ3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AGAP1Q9UPQ3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AGAP1Q9UPQ3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AGAP1Q9UPQ3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AGAP1Q9UPQ3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AGAP1Q9UPQ3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AGAP1Q9UPQ3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
AGAP1Q9UPQ3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
AGAP1Q9UPQ3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGAP1Q9UPQ3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGAP1Q9UPQ3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGAP1Q9UPQ3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGAP1Q9UPQ3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGAP1Q9UPQ3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGAP1Q9UPQ3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGAP1Q9UPQ3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
AGAP1Q9UPQ3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGAP1Q9UPQ3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGAP1Q9UPQ3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGAP1Q9UPQ3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGAP1Q9UPQ3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGAP1Q9UPQ3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGAP1Q9UPQ3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGAP1Q9UPQ3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGAP1Q9UPQ3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGAP1Q9UPQ3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
AGAP1Q9UPQ3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGAP1Q9UPQ3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGAP1Q9UPQ3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGAP1Q9UPQ3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGAP1Q9UPQ3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGAP1Q9UPQ3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGAP1Q9UPQ3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGAP1Q9UPQ3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGAP1Q9UPQ3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGAP1Q9UPQ3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGAP1Q9UPQ3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGAP1Q9UPQ3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGAP1Q9UPQ3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGAP1Q9UPQ3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGAP1Q9UPQ3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGAP1Q9UPQ3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
AGAP1Q9UPQ3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGAP1Q9UPQ3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGAP1Q9UPQ3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms