Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms