Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PCDHA12Q9UN75 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCDHA12Q9UN75 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCDHA12Q9UN75 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCDHA12Q9UN75 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCDHA12Q9UN75 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCDHA12Q9UN75 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCDHA12Q9UN75 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCDHA12Q9UN75 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCDHA12Q9UN75 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCDHA12Q9UN75 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCDHA12Q9UN75 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCDHA12Q9UN75 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCDHA12Q9UN75 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCDHA12Q9UN75 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCDHA12Q9UN75 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCDHA12Q9UN75 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCDHA12Q9UN75 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCDHA12Q9UN75 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCDHA12Q9UN75 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCDHA12Q9UN75 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCDHA12Q9UN75 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PCDHA12Q9UN75 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PCDHA12Q9UN75 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PCDHA12Q9UN75 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PCDHA12Q9UN75 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PCDHA12Q9UN75 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PCDHA12Q9UN75 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PCDHA12Q9UN75 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PCDHA12Q9UN75 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PCDHA12Q9UN75 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms