Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DENND2AQ9ULE3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
DENND2AQ9ULE3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
DENND2AQ9ULE3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
DENND2AQ9ULE3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
DENND2AQ9ULE3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
DENND2AQ9ULE3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
DENND2AQ9ULE3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DENND2AQ9ULE3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DENND2AQ9ULE3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DENND2AQ9ULE3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DENND2AQ9ULE3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
DENND2AQ9ULE3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
DENND2AQ9ULE3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DENND2AQ9ULE3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DENND2AQ9ULE3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DENND2AQ9ULE3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DENND2AQ9ULE3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DENND2AQ9ULE3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DENND2AQ9ULE3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DENND2AQ9ULE3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DENND2AQ9ULE3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DENND2AQ9ULE3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DENND2AQ9ULE3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DENND2AQ9ULE3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DENND2AQ9ULE3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DENND2AQ9ULE3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DENND2AQ9ULE3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DENND2AQ9ULE3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DENND2AQ9ULE3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DENND2AQ9ULE3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DENND2AQ9ULE3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
DENND2AQ9ULE3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DENND2AQ9ULE3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DENND2AQ9ULE3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DENND2AQ9ULE3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DENND2AQ9ULE3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DENND2AQ9ULE3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DENND2AQ9ULE3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DENND2AQ9ULE3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DENND2AQ9ULE3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DENND2AQ9ULE3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DENND2AQ9ULE3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DENND2AQ9ULE3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DENND2AQ9ULE3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DENND2AQ9ULE3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DENND2AQ9ULE3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
DENND2AQ9ULE3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DENND2AQ9ULE3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DENND2AQ9ULE3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DENND2AQ9ULE3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DENND2AQ9ULE3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DENND2AQ9ULE3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DENND2AQ9ULE3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DENND2AQ9ULE3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DENND2AQ9ULE3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DENND2AQ9ULE3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DENND2AQ9ULE3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DENND2AQ9ULE3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DENND2AQ9ULE3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DENND2AQ9ULE3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DENND2AQ9ULE3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DENND2AQ9ULE3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DENND2AQ9ULE3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DENND2AQ9ULE3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
DENND2AQ9ULE3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DENND2AQ9ULE3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DENND2AQ9ULE3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DENND2AQ9ULE3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DENND2AQ9ULE3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DENND2AQ9ULE3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
DENND2AQ9ULE3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DENND2AQ9ULE3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DENND2AQ9ULE3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
DENND2AQ9ULE3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DENND2AQ9ULE3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DENND2AQ9ULE3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DENND2AQ9ULE3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DENND2AQ9ULE3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DENND2AQ9ULE3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DENND2AQ9ULE3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DENND2AQ9ULE3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DENND2AQ9ULE3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DENND2AQ9ULE3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DENND2AQ9ULE3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DENND2AQ9ULE3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DENND2AQ9ULE3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DENND2AQ9ULE3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DENND2AQ9ULE3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DENND2AQ9ULE3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DENND2AQ9ULE3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DENND2AQ9ULE3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
DENND2AQ9ULE3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DENND2AQ9ULE3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DENND2AQ9ULE3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
DENND2AQ9ULE3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
DENND2AQ9ULE3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
DENND2AQ9ULE3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
DENND2AQ9ULE3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
DENND2AQ9ULE3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms