Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HDAC9Q9UKV0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HDAC9Q9UKV0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HDAC9Q9UKV0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HDAC9Q9UKV0 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HDAC9Q9UKV0 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HDAC9Q9UKV0 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HDAC9Q9UKV0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HDAC9Q9UKV0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HDAC9Q9UKV0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HDAC9Q9UKV0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HDAC9Q9UKV0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HDAC9Q9UKV0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HDAC9Q9UKV0 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HDAC9Q9UKV0 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
HDAC9Q9UKV0 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HDAC9Q9UKV0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HDAC9Q9UKV0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
HDAC9Q9UKV0 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HDAC9Q9UKV0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HDAC9Q9UKV0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDAC9Q9UKV0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDAC9Q9UKV0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDAC9Q9UKV0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDAC9Q9UKV0 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDAC9Q9UKV0 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDAC9Q9UKV0 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDAC9Q9UKV0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDAC9Q9UKV0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDAC9Q9UKV0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HDAC9Q9UKV0 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HDAC9Q9UKV0 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
HDAC9Q9UKV0 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HDAC9Q9UKV0 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HDAC9Q9UKV0 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HDAC9Q9UKV0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HDAC9Q9UKV0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HDAC9Q9UKV0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDAC9Q9UKV0 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDAC9Q9UKV0 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDAC9Q9UKV0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDAC9Q9UKV0 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDAC9Q9UKV0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDAC9Q9UKV0 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDAC9Q9UKV0 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDAC9Q9UKV0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDAC9Q9UKV0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDAC9Q9UKV0 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDAC9Q9UKV0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDAC9Q9UKV0 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
HDAC9Q9UKV0 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HDAC9Q9UKV0 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HDAC9Q9UKV0 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
HDAC9Q9UKV0 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HDAC9Q9UKV0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HDAC9Q9UKV0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms