Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PACSIN3Q9UKS6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms